اتهمت غرفة عمليات حزب المصريين الأحرار بعض الموظفين بلجان الانتخابات بتوجيه الناخبين لاختيار مرشحين بعينهم في الجولة الثانية من انتخابات مجلس الشعب. وأورد تقرير اللجنة عن تجاوزات ومخالفات المرحلة الثانية من انتخابات 2011 أن موظفي اللجنة 196 بمدرسة رفاعة الطهطاوي الابتدائية بإمبابة بمحافظة الجيزة وجهوا الناخبة عايدة محمد على إلى انتخاب مرشحي حزب الحرية والعدالة داخل اللجنة. وقال التقرير أن موظفي لجنتي 451 و452 يوجهون الناخبين إلى اختيار مرشحى حزب النور بمدرسة 6 أكتوبر الابتدائية بالبراجيل – محافظة الجيزة . وكذلك وجه التقرير اتهام إلى موظفة بلجنة 63 بمدرسة بنى قاسم الابتدائية بنين توجه الناخبين لاختيار المرشح / نهاد القاسم – مركز ببا – محافظة بني سويف. وأفاد بأن أحد موظفي لجنتي 68 و67 بمدرسة عبد المحسن طاهر رزق بقسم أول أسوان يوجه الناخبين لمرشحين بعينهم – محافظة أسوان. وأورد التقرير أن الناخبة التى تحمل الرقم القومي 2780426210129 تؤكد أنها أدلت بصوتها فى ورقة تصويت الفردي بينما موظف الانتخابات هو من قام بالتصويت بورقة القوائم وذلك باللجنة 85 بمدرسة الكوم الأحمر الإعدادية بنات – لجنة السيدات – مركز أوسيم – الجيزة . وأفاد التقرير بأن احدي الناخبات وجدت توقيع أمام أسمها ورقمها الانتخابي واخبرها رئيس اللجنة بأنها مشكلة اللجنة العليا للانتخابات وعليها الشكوى لهم وذلك باللجنة 195 و 196 بمدرسة الإيمان الابتدائية الجديدة – حي فيصل بمنطقة المثلث – السويس . وبالنسبة لتجاوزات أنصار المرشحين، اتهمت الغرفة مندوبي المرشحين فؤاد زغلة وموسي على سليمان بمدرسة نجع هلالي الابتدائية – بمركز إدفو بكتابة أسماء مرشحيهم ورمزهم على أيدي الناخبين الأميين ليظهروه لرؤساء اللجان عند التصويت – محافظة أسوان . واتهمت مندوب حزب النور بلجنتي 406 و407 بتوجيه الناخبين أمام رئيس اللجنة بمدرسة عزام الابتدائية – أبو حمص – البحيرة. ومن المخالفات، رصد التقرير وقوع مشادة كلامية بين احد رؤساء اللجان بمدرسة مني الأمير الابتدائية بالحوامدية والضابط المسئول عن التأمين ﴿عقيد قوات مسلحة ﴾ بسبب عدم التنظيم والزحام – محافظة الجيزة . وكذلك وقوع مشادة بين أنصار حزب الحرية والعدالة وحزب النور بسبب تكالبهم على استقطاب الناخبين أمام المعهد العدوي الأزهري / محافظة بنى سويف، وأخرى بين أنصار حزب النور وحزب الوسط بسبب توجيه الناخبين أمام مدرسة الكلح بشرق المفالسة - أسوان وكذلك مشادات بين الناخبين أمام مدرسة أم الأبطال الثانوية بالطالبية – الهرم. وقال التقرير انه جرت اشتباكات بالأيدى أدت لوقف العمل بلجنة المجلس القروى بنيدة بين أنصار المرشح معهد حجازى والمرشح طه الجلوي قبل أن تفتح مرة أخري – مركز أخميم – محافظة سوهاج . ورصد مخالفة إغلاق لجنة مدرستي الشهيد احمد رشوان و جمال عبد الناصر الابتدائية بمحافظة سوهاج للغذاء. وذكر التقرير أن حالة من الحيرة انتابت الناخبين بقرية البلابيش بحري بسبب إلغاء انتخابات القائمة بالدائرة الثانية بسوهاج.بجانب وقف العمل بلجنة المجلس القروى بنيدة بسبب مشادات واشتباكات بالايدى بين أنصار المرشح محمد حجازى رمز الحنفية - عمال والمرشح طه الجلوي رمز الحمامة - عمال محافظة سوهاج. ومن المخالفات تأخر فتح لجان الوحدة الصحية و مدرسة القرامطة الابتدائية بقرية القرامطة شرق متأخرين أكثر من ساعة محافظة سوهاج