كشف البابا شنودة الثالث بابا الإسكندرية وبطريرك الكرازة المرقسية عن تجميد المجلس الملي العام ودوره داخل الكنيسة وقال ردا علي سؤال من أحد الأقباط خلال عظته الأسبوعية أمس الأول حول دور المجلس حاليا: «إن المجلس الملي في الوقت الحالي لا يجتمع أبدا وبالتالي كل لجانه لا تجتمع ولا يستطيع أحد أن يتكلم باسم المجلس حاليا ومن يتكلم لا صفة له». جاءت تصريحات البابا حول تجميد أعمال المجلس الملي بعد الأزمة التي شهدها المجلس نهاية العام الماضي وما أثير حول استقالة د.ثروت باسيلي عضو مجلس الشوري ووكيل المجلس الملي الأمر الذي رفضه البابا ولكن تصريحات البطريرك كشفت عن اختفاء الدور الرئيسي للمجلس داخل الكنيسة حيث لم يجتمع البابا بأعضائه منذ عام. وأكد البابا شنودة خلال عظته بالكائدرائية المرقسية بالعباسية أنه لا يمكن ولا يجوز دعوة انعقاد المجمع المقدس دون وجود البابا، وقال: «إن المجمع ينعقد رسميا برئاسة البطريرك ويوقع علي قراراته وتوصياته». وقال البابا إن الكنيسة تدعم تحسين العلاقات مع إثيوبيا بحكم الارتباط التاريخي الوثيق بين الكنيستين إذ إن كنيسة إثيوبيا تشارك في اختيار بطريرك مصر.