فيما يلي سجل مشاركات الأهلي المصري في بطولة دوري أبطال افريقيا لكرة القدم منذ تغيير نظام البطولة عام 1997. 1997: لم يشارك . 1998: خرج من دور 32 أمام البن الاثيوبي بتعادله خارج أرضه 1-1 وتعادله علي أرضه 2-2 ليستفيد المنافس من قاعدة احتساب الهدف خارج الأرض بهدفين عند التعادل في النتيجة الإجمالية. 1999: خرج من دور الثمانية (دور المجموعتين). 2000: خرج من دور الثمانية. 2001: أحرز اللقب بتفوقه علي صن داونز الجنوب افريقي 4-1 في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2002: خرج من دور الثمانية. 2003: لم يشارك . 2004: خرج من دور 32 بعد خسارته أمام الهلال 1-صفر في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2005: أحرز اللقب بفوزه علي النجم الساحلي التونسي 3-صفر في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2006: أحرز اللقب بتفوقه على الصفاقسي التونسي 2-1 في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2007: بلغ الدور النهائي وخسر أمام النجم الساحلي التونسي 3-1 في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2008: أحرز اللقب بتفوقه على كوتون سبور الكاميروني 4-2 في مجموع مباراتي الذهاب والِإياب. 2009: خرج من دور الستة عشر بعدما تعادل خارج أرضه مع كانو بيلارز النيجيري 1-1 وعلى أرضه 2-2 ليستفيد المنافس من قاعدة احتساب الهدف خارج الأرض بهدفين عند التعادل في النتيجة الإجمالية. 2010: خرج من الدور قبل النهائي أمام الترجي التونسي بعد فوزه على أرضه 2-1 وخسارته خارج أرضه 1-صفر ليستفيد المنافس من قاعدة احتساب الهدف خارج الأرض بهدفين عند التعادل في النتيجة الإجمالية. 2011: خرج من دور الثمانية. 2012: أحرز اللقب بتفوقه 3-2 على الترجي التونسي في مجموع مباراتي الذهاب والإياب. 2013: تأهل إلى النهائي وتعادل ذهابا في جنوب افريقيا 1-1 مع اورلاندو بايرتس. * يحمل الأهلي الرقم القياسي في الفوز ببطولة افريقيا برصيد سبع مرات منها مرتان في النظام القديم للمسابقة عامي 1982 و1987 .
