كشف تقرير للجهاز المركزي للمحاسبات عن أكثر من عشر ملاحظات كارثية في أداء النقابات المهنية عن عام 2008 في مقدمتها عدم قيام بعض النقابات بموافاة الجهاز بميزانياتها وحساباتها الختامية وعدم عقد بعضها الجمعيات العمومية لعدة سنوات. كما كشف التقرير الذي أرسله الدكتور جودت الملط رئيس الجهاز إلي الدكتور فتحي سرور رئيس مجلس الشعب عن صرف بعض النقابات لمبالغ دون وجه حق لبعض النقابات وعدم استفادة بعضها من الأصول التي تمتلكها وعدم تحقيقها أي عائد استثماري من رءوس الأموال التي تمتلكها في الشركات والبنوك إضافة إلي عدم قيام بعض النقابات والاتحادات باتخاذ الإجراءات اللازمة لتحصيل مستحقاتها لدي الغير منذ سنوات وعدم اتخاذ الإجراءات اللازمة ضد الأعضاء المشتركين بمعارض السلع المعمرة المتأخرين عن سداد الأقساط المستحقة عليهم، وعدم التزام بعض النقابات بالقوانين الخاصة بالرقابة الداخلية ولجؤها إلي الصرف مباشرة من التحصلات الخاصة بها دون إيداعها بالبنوك أولا.