أثار تدخل جماعة الإخوان المسلمين لحل مشاكل عمال "طنطا للكتان" أزمة داخل الاوساط العمالية حيث أكدت القيادات النقابية داخل الاتحاد العام لنقابات عمال مصر أنهم لن يسمحوا لأي حزب باختراق صفوف العمال وذلك في الوقت الذي أكد فيه عدد من العمال المعتصمين انهم لا ينتمون إلي أي حزب وان مصلحتهم الحصول علي حقوقهم ومستحقاتهم المتأخرة فقط.. أكد عبدالمنعم الغزالي النائب الأول لرئيس الاتحاد العام لنقابات عمال مصر ان الاتحاد لن يسمح لأي حزب باختراق صفوف العمال.. وفي غضون ذلك أكد سعيد الجوهري رئيس النقابة العامة للعاملين بالغزل والنسيج انه ارسل خطاباً لمنظمة العمل الدولية لاتخاذ الاجراءات اللازمة تجاه المستثمر المالك للشركة ومساندة العمال ضد المستثمر. وأشار الجوهري انه لن يسمح لجماعة الإخوان بالتدخل في أمور العمال لانها في طريقها للحل مؤكداً ان الإخوان يحاولون ابراز مكانتهم التي لا وجود لها داخل صفوف العمال لأن العمال لا ينساقون وراء الشعارات التي يحاول ان يهدف لها جماعة الاخوان المسلمين.