أعتبر الكاتب الصحفي مصطفى بكري أن حكومة الدكتور محمد مرسي متورطة في الحرب الدائرة بسوريا، واصفاً تصريحات سكرتير الرئيس للشئون السياسية خالد القزاز بشأن عدم محاكمة المجاهدين في دمشق عند عودتهم إلى البلاد بالمخيب للآمال لأنه يؤكد أن القاهرة تدعم المتطرفين حول العالم. وذكر بكري في تغريده عبر صفحته بموقع التواصل الاجتماعي «فيس بوك» أن "الموقف الذي اتخذته الرئاسة يعني إقرارا صريحا بأن القيادة المصرية الحاكمة أكدت أنها متورطة في الحرب ضد سوريا بشكل رسمي وأنها تدعم إرسال المقاتلين وترعاهم وتوفر لهم الضمانات الكاملة وتضمن عدم محاكمة أي منهم عقب عودتهم إلى بلادهم". وسخر الكاتب الصحفي من موقف الرئاسة، منوهاً أن مصر تعد بذلك الدولة الوحيدة التي أعلنت دعم العمليات الإرهابية ضد بلد عربي وهو أمر ستكون له انعكاساته الخطيرة على علاقة الشعبين السوري والمصري لفترة طويلة". وأشار بكري إلى أن موقف الرئاسة من الحرب في سوريا يؤكد أن جماعة الإخوان المسلمين أعطت الضوء الأخضر لعناصر الإرهاب للتآمر ضد الدول الأخرى الشقيقة.