اتهم وزير الدفاع السوداني عبدالرحيم محمد حسين الاثنين، دولة جنوب السودان، باستمرار دعم متمردي الحركة الشعبية قطاع الشمال المناهضة لحكومة الخرطوم، بحسب فضائية الشروق (القريبة من الحكومة). ونقلت وكالة "الأناضول" عن الوزير قوله أمام البرلمان السوداني :"إن دعم حكومة جوبا لمتمردي الحركة الشعبية التي تقاتل الحكومة، في ولايتي جنوب كردفان والنيل الأزرق (المتاخمتين لجنوب السودان) لا يزال مستمرًا". وانتقد وزير الدفاع "البطء الذي لازم تنفيذ اتفاق الترتيبات الأمنية مع جنوب السودان"، قائلاً إن "الاتفاقات الموقعة مع جنوب السودان لم تنفّذ على الأرض، خاصة فيما يتعلق بترسيم الخط الصفري والمنطقة المعزولة إلى جانب آليات مراقبة الحدود بين البلدين". وانفصل الجنوب عن الشمال بموجب اتفاقية سلام أبرمت عام 2005 أنهت واحدة من أطول الحروب الأهلية في أفريقيا، ومهدت الاتفاقية لإجراء استفتاء شعبي في يناير/كانون الثاني 2011، صوّت فيه الجنوبيون بنسبة تفوق ال98% لصالح الانفصال. ووقع السودان وجنوب السودان في 27 سبتمبر/أيلول 2012 اتفاق التعاون المشترك والتي أنهت توترًا بين البلدين استمر منذ استقلال جنوب السودان.