ذكرت وسائل الاعلام الاسرائيلية ان دولة جنوب السودان ستفتح سفارة لها فى مدينة القدسالمحتلة وليس فى العاصمة السياسية لإسرائيل مدينة "تل أبيب"، مما يعتبر استفزازاً واضحاً للدول العربية والإسلامية، والتى ترفض اعتبار القدس عاصمة للدولة العبرية. واضافت أن السفير الإسرائيلى فى جنوب السودان "دان شاهام" قد التقى مع نائب رئيس جنوب السودان ريك ماشار لمناقشة قضايا التعاون الثنائى، مضيفة بأن ماشار أكد له أن جوبا تستعد لفتحا سفارتها بالقدس وليس تل أبيب. من جهتها قالت صحيفة "يديعوت أحرونوت" الإسرائيلية: إن النقاشات التى أجراها السفير الإسرائيلى مع المسئول الجنوب سودانى شملت دعم الحكومة الإسرائيلية لدولة جنوب السودان، وكذلك أوضاع 1500 شخص من جنوب السودان يقيمون حاليا فى إسرائيل بهدف تدريبهم على مختلف المهارات حتى يتمكنوا من المساهمة فى بناء دولتهم الجديدة والعودة إليها.