صرح الدكتور شفيق -في بيان صدر عنه مساء اليوم- بعد لحظات من اعلان الكنيسة المرقسية نياحة قداسته ان هذا خسارة عظيمه لمصر، مضيفا "فقدنا قيمه كبيرة وحبرا جليلا وشخصية وطنية حظيت بتقدير كل المصريين مسلمين واقباط، واحترام المجتمع الدولي والشخصيات العالمية" وتقدم شفيق بالعزاء إلى كل المصريين خصوصا الأقباط، مؤكدا على أن الكنيسة المصرية العريقة قادرة على أن تعبر هذه اللحظة العصيبة بفضل الميراث العظيم لقداسة البابا شنودة. كما توجه د.عبدالمنعم أبوالفتوح في اتصال هاتفي بخالص تعازيه للأنبا موسى، أسقف الشباب بالكنيسة الأرثوذكسية، الأخوة الأقباط، وذلك في وفاة البابا شنودة الثالث، بابا الإسكندرية، وبطريرك الكرازة المرقسية.