منذ ظهور حسن البنا مؤسس جماعة الإخوان المسلمين فى مصر عام 1928 والعداء بينهم وبين العسكر لم ينقطع فسرعان ما انتشر فكر هذه الجماعة، فنشأت جماعات أخرى تحمل فكر الإخوان في العديد من الدول، ووصلت الآن إلى 72 دولة تضم كل الدول العربية ودولاً إسلامية وغير إسلامية في القارات الست . فطبقا للمادة 9 من اللائحة الداخلية للإخوان المعدلة عام 1948م يحتل المرشد العام المرتبة الأولى في الجماعة باعتباره رئيساً لها، ويرأس في نفس الوقت جهازي السلطة فيها وهما مكتب الإرشاد العام ومجلس الشورى العام.
أما المرشد العام فيُنتخب عن طريق مجلس الشورى العام ويجب أن يكون قد مضى على انتظامه في الجماعة مدة لا تقل عن خمس عشرة سنة هلالية ولا يقل عمره عن أربعين سنةً هلاليةً ، وبعد انتخابه يبايعه أعضاء الجماعة، وعليه التفرغ تماما لمهام منصبه للعمل بالجماعة، فلا يصح له المشاركة في أي أعمال أخرى عدا الأعمال العلمية والأدبية بعد موافقة مكتب الإرشاد عليها، ويظل المرشد في منصبه لمدة ست سنوات، قابلة للتجديد مرة واحدة ، ويختار المرشد العام نائبا له أو أكثر من بين أعضاء مكتب الإرشاد العام، وفي حالة وفاته أو عجزه عن تأدية مهامه، يقوم نائبه بعمله إلى أن يجتمع مجلس الشوري العام لانتخاب مرشد جديد، وكذلك يمكن لمجلس الشوري العام ان ينحي المرشد إذا خالف واجبات منصبه.
غير أن انتخاب المرشد، بحسب الإخوان، لا يتم حالياً إلا بواسطة أعضاء مكتب الإرشاد لسبب احترازات أمنية تحول دون اجتماع مجلس الشوري العام، حيث قامت قوات الأمن المصرية في عام 1995م أثناء اجتماعه بالقبض على غالبية المشاركين فيه، وتم تحويلهم إلى محاكمات عسكرية حكمت على كثيرين منهم بالسجن مددا تتراوح من ثلاث إلى خمس سنوات.
أما مجلس الشورى العام العالمي :_
مجلس الشورى العام (أو كما كان يسمي الهيئة التأسيسية) هو السلطة التشريعية لجماعة الإخوان المسلمين، وقراراته ملزمة، ومدة ولايته أربع سنوات هجرية. وتتضمن مهامه الإشراف العام على الجماعة وانتخاب المرشد العام .
أما أعضاء المجلس :_
أ- يتألف مجلس الشورى العام من ثلاثين عضوا على الأقل، يمثلون التنظيمات الإخوانية المعتمدة في مختلف الأقطار، ويتم اخيتارهم من قبل مجالس الشورى في الأقطار أو من يقوم مقامهم. ويحدد عدد ممثلي كل قطر بقرار من مجلس الشورى.
ب- يجوز لمجلس الشورى إضافة خمسة أعضاء من ذوي الاختصاص إلى عضوية المجلس. ج- يمكن تمثيل أي تنظيم إخواني جديد في مجلس الشورى إذا اعتمده مكتب الإرشاد العام. د- يجب أن يكون المراقبون العموميون للأقطار أعضاء في المجلس، وإذا تعذر مشاركة مراقب عام كعضو ثابت في المجلس يمكن للقطر اختيار غيره. ، ويحتفظ المرشد العام بعد انتهاء ولايته بعضوية مجلس الشورى العالمي مدى الحياة، إلا إذا كان انتهاء الولاية نتيجة الإخلال بواجباته أو فقد الأهلية.
أما مصدر تمويل الإخوان فيختلف فيه الكثيرون منهم من يري أنه ذاتي ،بمعنى أن الإخوان يعتمدون على تمويل أعضاء الجماعة للقيام بالأنشطة المختلفة التي يمارسها الإخوان ، ووفقاً للنظام الأساسي للجماعة فإن أعضاء الجماعة مقسمين، على حسب ما تصنفهم الجماعة، إلى مؤيد ومنتسب ومنتظم وعامل، على التوالي ووفقاً لآليات تحددها الجماعة يتم تصعيد العضو من مرحلة إلى أخرى أو من تصنيف إلى آخر، وذلك بعد اجتياز عدد من الاختبارات السلوكية والتثقيفية داخل الجماعة، ومن ذلك يلتزم العضو بدفع اشتراك شهري للجماعة، يقتطعه من دخله الشهري ، ويستثنى من ذلك الإخوان المصنفين كمؤيدين والطلاب وأصحاب الرواتب الضعيفة. كما أن بعض الأنشطة التي يمارسها الاخوان تمول نفسها ذاتياً مثل المستشفيات ودور الرعاية التي تقدم خدماتها نظير رسوم الخدمة. فيما يري البعض أن الجماعة تمول من بعض الدول العربية منها على سبيل المثال قطر ، وبعض الدول التى تنتمى الى التنظيم الدولى للإخوان.
أما فكر الجماعة : _ فقد ذكر حسن البنا في رسالة المؤتمر الخامس تحت عنوان (إسلام الإخوان المسلمين) "أن الإسلام عقيدة وعبادة، ووطن وجنسية، وروحانية وعمل، ومصحف وسيف". وذكر أيضاً "أن فكرة الإخوان المسلمين نتيجة الفهم العام الشامل للإسلام، قد شملت كل نواحي الإصلاح في الأمة، فهي دعوة سلفية، وطريقة سنية، وحقيقة صوفية، وهيئة سياسية، وجماعة رياضية، ورابطة علمية ثقافية، وشركة اقتصادية، وفكرة اجتماعية"
وأضاف فى نفس الرسالة أن خصائص دعوة الإخوان التي تميزت بها عن غيرها من الدعوات :_ البعد عن مواطن الخلاف البعد عن هيمنة الأعيان والكبراء البعد عن الأحزاب والهيئات العناية بالتكوين والتدرج في الخطوات إيثار الناحية العملية الإنتاجية على الدعاية والإعلانات شدة الإقبال من الشباب سرعة الانتشار في القرى والمدن.
ووضع حسن البنا عشرة أركان للبيعة لدي الإخوان في رسالته الشهيرة رسالة التعاليم وهي (الفهم والإخلاص والعمل والجهاد والتضحية والطاعة والثبات والتجرد والأخوَّة والثقة)
وذكر ضمن ركن الفهم الأصول العشرين لفهم الإخوان للإسلام والتي تعتبر الرؤية والأرضية التي تقوم عليها الجماعة في كل مكان ، وقام العديد من مفكري الجماعة بشرح هذه الأصول مثل الدكتور يوسف القرضاوي والشيخ جمعة أمين. وتشترط جماعة الإخوان المسلمين علي التنظيمات الإخوانية في العالم فهم الإسلام ضمن الأصول العشرين .
فبعد جولة الإعادة من الإنتخابات الرئاسية ، واعلان فوز الدكتور محمد مرسي رئيس الحزب الذى لم يدعو له المؤسس الأول "البنا" بإنتخابات رئاسة الجمهورية أصبح إستمرار الصدام مع العسكري أكيد فبعد إصدر الإعلان الدستوى المكمل لم يعد للرئيس الإخوانى اية مميزات ، أو صلاحيات ، فكما أكد الكثيرون أن الرئيس القادم سيكون لعبة فى يد العسكر .
فستون عاما من حكم العسكر ، وإضطهاد الجماعة ، وتهميش وحبس مؤيديها أصبحوا الأن فى عام 2012 على أعتاب جنة الخالدين حيث رئاسة جمهورية مصر العربية " أكبر دولة فى المنطقة بحكم الجغرافيا ، ، والتاريخ ، وعدد السكان ".
فالراحليين من العسكر" جمال عبدالناصر ، والسادات ، ومبارك" لم يتركوا للإخوان المجال الحصول على السلطة ، لكن بفضل الديمقراطية تمكنوا من الحصول على الرئاسية .
فالسؤال الذى يطرح نفسه هل سيسير المجلس العسكري بقيادة المشير طنطاوى على نهج السابقين ممن حكموا البلاد لمدة ستون عاما بقبضة عسكرية ؟ ويمنع إستحواذ الإخوان على الرئاسية ، والتشريعية ، و كافة المناصب القيادية على غرار الوطنى المنحل ، أما سيترك الأمر ؟