أغلقت اللجان الفرعية على مستوى الجمهورية، وعددها 13 ألفا و706 لجان فرعية، أبوابها في تمام الساعة التاسعة مساء في ثاني أيام الاقتراع في الانتخابات الرئاسية. وكانت الهيئة الوطنية للانتخابات برئاسة المستشار لاشين إبراهيم، قد وضعت عدة قواعد للقضاة المشرفين على الانتخابات، وهي أن يبدأ التصويت فى التاسعة صباحًا حيث يبدأ الاقتراع بالسماح لرئيس وأمناء وأعضاء اللجنة الفرعية بالإدلاء بأصواتهم وإثبات ذلك فى نموذج التصويت بالانتخابات الرئاسية، ثم السماح للناخبين بالدخول بأولوية الحضور والاقتراع بعد التأكد من هوية الناخب وعدم وجود حبر فسفورى على أى من أصابع الناخب، وتختم بطاقة الاقتراع على ظهرها وتعطى للناخب لتصويت عليها ثم وضعها بصندوق الاقتراع وتسجيل اسمه فى كشوف المصوتين حتى لا يقوم بالتصويت مرة أخرى. وأضافت الهيئة الوطنية للانتخابات فى قواعدها الإرشادية، بأنه نظرًا لقيام بعض الناخبين بتصوير بطاقات الاقتراع باستخدام الهاتف المحمول لتقديمه دليلًا على انتخابهم مرشحًا بعينه، وهو ما قد يشى باحتمال التصويت تحت تأثير وعد أو عيد، فإنه يجب على رؤساء اللجان منع ذلك وتحرير مذكرة بالواقعة لمن يتم ضبطه، كما أنه يتم تحرير مذكرة لمن يحاول عدم وضع بطاقة الاقتراع فى الصندوق والخروج بها. ونبهت الهيئة الوطنية للانتخابات على رؤساء اللجان التأكد من شخصية المرأة المنتقبة وعدم سبق غمس أحد أصابعها فى الحبر الفسفورى قبل تصويتها، وفى حالة رفضها لا يسمح لها بالتصويت، كما نبهت الهيئة على رؤساء اللجان بعدم غلق اللجنة قبل التاسعة مساء حتى لو لم يكن هناك ناخبين داخل الحرم الانتخابي، كما يسمح التصويت بعد التاسعة فى حال وجود ناخبين داخل الحرم الانتخابي. وكانت قد انطلقت صباح اليوم الانتخابات الرئاسية في الداخل وتستمر ل 3 أيام. وأكد المستشار محمود الشريف نائب رئيس الهيئة الوطنية للانتخابات، أن غرفة العمليات المشكلة بداخل الهيئة، تلقت ما يفيد انتظام العمل بكافة لجان الاقتراع في الانتخابات الرئاسية على مستوى الجمهورية في مواعيدها المحددة في التاسعة صباحا، عدا 12 لجنة تأخرت لمدد لم تزد عن 20 دقيقة. وأضاف الشريف خلال مؤتمر صحفي، عقدته الهيئة لاستعراض سير تصويت المصريين في الداخل، أن هناك عده شكاوي وردت للجنة من خلال الخط الساخن ( 19826 ) لتلقي شكاوى المواطنين في شأن العملية الانتخابية، حول تأخر بعض اللجان في فتح أبوابها أو غلق اللجان، وقامت اللهيئة بفحص تلك الشكاوي علي الفور والتواصل مع رؤساء تلك اللجان.
