قال خالد الجندي، عضو المجلس الأعلى للشئون الإسلامية، تعليقًا على تكفير الباحث إسلام بحيري على الهواء: "موقف الأزهر ثابت، لا نكفر أحدًا لأن الحكم على أمر عقائدي مكانه في القلب لا يحكم أحد عليه". وأضاف الجندي خلال تقديم برنامج "لعلهم يفقهون" المذاع عبر فضائية"dmc" ، اليوم الخميس، أن ما فعله الدكتور أحمد حسني طه، القائم بأعمال رئيس جامعة الأزهر، من الحكم بالردة على إسلام بحيري، أفزعنا لأنه ليس منهج الأزهر، الذي يرفض التكفير بكل أساليبه، فالأزهر لم يكفر داعش، فكيف يمكن أن يكفر باحثا؟! وأشار إلى أن هذا الحكم مخالف لما استقرت عليه العقيدة الأشعرية الصوفية"، قائلا: "كل إنسان له ما له وعليه". وكان الدكتور أحمد حسنى طه، أصدر بيان اعتذار وتوضيح، موضحا أن وصف "بحيرى" بالمرتد رد غير صحيح، ويخالف منهج الأزهر الشريف، الذى يقضى بأنه لا يُخرج المرء من الإسلام إلا جحد ما أدخله فيه. واعترف حسني فى بيانه، باستعجاله فى الرد بما ظهر أنه حكم على شخص، وهذا تجاوز لا يعبر عن منهج الأزهر أبدا، وهو ما أدركه لاحقا، معترفا بأنه وقع فيه دون قصد.