سيطر أعضاء المجلس القومي لحقوق الانسان المنتمون لجماعة الإخوان المسلمين علي رئاسة اللجان الهامة بالمجلس، حيث تم إرجاء اختيار تشكيل اللجان لاجتماع المجلس الأحد بدلا من يوم الاجتماع الأول. أكدت تسريبات الاجتماع الذي مازال منعقدا حتي كتابة هذه السطور تولي الدكتور محمود غزلان أمانة وحدة نشر ثقافة حقوق الإنسان، والتي استحدثت بعد ان كانت متوقفة منذ سنوات، فيما تولي الدكتور محمد البلتاجي أمانه لجنة الحقوق السياسية والمدنية وطارق معوض مساعدا له. وطبقا للتسريبات تولي محمد طوسون وحدة الخطة والبحث والتطوير التشريعي 'المشروع الاسباني'، فيما تولي دكتور عبد الله الأشعل أمانة لجنة العلاقات الدولية ود. مني مكرم عبيدا مساعدا له. واعتمد المجلس أيضا محمد باهي أمانة اللجنة التشريعية، فيما تولي إيهاب الخراط أمانة وحدة التعذيب، وصفوت حجازي وحدة الرصد والتوثيق، ومحمد الدماطي وحدة الانتخابات، وتولت د. أميرة أبو الفتوح أمانة لجنة الحقوق الثقافية، وماريان ملاك لجنة الخطة القومية للمجلس.