يواجه اتحاد نقابات المهن الطبية مشكلة تحصيل الاشتراكات الفعلية لاعضائها والتي تزيد عن 53 مليون جنيه، وهي عبارة عن الحصص السنوية من تحصيل اشتراكات الاعضاء الي صندوق معاشات الاتحاد. وكان أمين صندوق الاتحاد د. نبيل العطار قد ارسل الي كل من نقابة الاطباء ومديونيتها تبلغ 61 مليون جنيه، ونقابة الصيادلة ومديونيتها 31 مليون جنيه، ونقابة الاطباء البيطرية ومديونيتها حوالي 5 ملايين جنيه ونقابة الاسنان وتبلغ مديونيتها مليون جنيه. وكلها مديونيات النقابات الاربعة (اعضاء الاتحاد) التي تقاعست عن سداد الاشتراكات التي تدفعها للاتحاد لصالح صندوق المعاشات. وقال العطار ان ضخامة المديونية يهدد الاتحاد وصندوق المعاشات بالانهيار الكامل نتيجة توقف الموارد الاخري كشركات الادوية والمستلزمات الطبية والمجازر والمصانع وهو ما يؤدي الي التوقف نهائيا عن سداد المعاشات والاعانات المقدمة للاعضاء وأسرهم، مشيرا الي ان أموال الاتحاد تتمتع بالحصانة القانونية التي منحها القانون لأموال النقابات المشتركة.