استعدت العديد من منظمات المجتمع المدنى، لمتابعة الشكاوى التى قد تحدث يومى الانتخابات الرئاسية، من خلال غرف عمليات لمتابعة سير العملية الانتخابية. قال محمد زارع رئيس المنظمة العربية للإصلاح الجنائى إنه تم بدء العمل بغرفة عمليات "البعثة المصرية لمتابعة الانتخابات الرئاسية" بمقر الجمعية المصرية للنهوض بالمشاركة المجتمعية لمدة 48 ساعة متواصلة لمتابعة فعاليات اليومين الانتخابيين بكل محافظات الجمهورية. ينظم أعمال البعثة ويشارك فيها 26 منظمة حقوقية، كما يشارك فى أعمالها حوالى 150 شخصية عامة مصرية من حقوقيين، برلمانيين، قانونيين، سياسيين، وتهتم غرفة عمليات البعثة بتلقى كل الشكاوى والاستفسارات من كل المواطنين المتابعين الميدانيين حول أي انتهاكات تمس العملية الانتخابية، عبر هواتف 0227957674، 01227665452، 01224001969،01069643258، 01282993820، 01222502603. وقالت هاجر أبو العينين مديرة غرفة عمليات الاتحاد العام للجمعيات والمؤسات الأهلية أن الاتحاد سوف يتابع الانتخابات الرئاسية في 13 محافظة بتلقي أية ملاحظات وشكاوى من المواطنين والمتابعين ومندوبى مرشحى الرئاسة عبر أرقام هواتف 01001635669، 01067414751، 01006285053، 01093161107، 01281392815، 01229372411 وعن حملة "مراقبينكم" قال يوسف عبد الخالق رئيس مؤسسة عالم جديد للتنمية وحقوق الإنسان إنه سوف يتم رصد الشكاوى الانتخابية والبلاغات التى ستقدم من الناخبين ومسئولى الحملات الانتخابية عن طريق الصور والفيديوهات ووضعها على خريطة تفاعلية إلكترونية تحدد مكان التجاوز والانتهاك من خلال أرقام تليفون 01010531839، و01001803423، و0120006811. وأوضح محمد محيى رئيس جمعية التنمية الإنسانية أحد "تحالف حرة نزيهة" لمتابعة الانتخابات الرئاسية، أن غرفة عمليات المتابعة ستكون فى مقر مركز ابن خلدون للدراسات الإنمائية، والمراقبين 10 آلاف مراقب، وسيتم تلقى البلاغات والانتهاكات الجسيمة فى 28 محافظة عبر هواتف 7/6/5/01022530944 – 9/8/5/4/3/ 2/01022530951