أدخل بنك مصر خدمة سداد الضرائب والجمارك بالتعاون مع المسئولين عن سداد المدفوعات الحكومة والهيئات الحكومية بوزارة المالية، وذلك من خلال نحو281 فرع منتشرة في جميع أنحاء الجمهورية. ويمنح البنك العملاء الراغبين فى سداد الضرائب عن طريق البنك العديد من المزايا تتمثل ابرزها فى ، تجنيب العميل المخاطر وتبسيط عملية السداد، وذلك عن طريق السداد المباشر لحساب العميل، مع إعطاء العميل مستند يفيد قيامه بالسداد. كما يمكن البنك العميل من السداد بوسائل مختلفة (نقدا أو خصما من الحساب الجارى)، فضلا عن إتاحة الخدمة للعملاء وغير العملاء، كما تساهم الخدمة في توفر عنصري الأمان والسرعة للعميل وذلك لعدم التقيد بالسداد داخل المأمورية المسجل بها، وعدم الالتزام بالتوزيع الجغرافي في إطار التيسير على الممولين وتحقيق اللامركزية في تحصيل الضرائب، وعدم المخاطرة في حمل الأموال للسداد. كان بنك مصر أول بنك في مصر يتيح السداد للجمارك سواء للأفراد أو الهيئات الحكومية منذ ديسمبر 2005، حيث تمكن هذه الخدمة العميل من الاستعلام عن الرسوم الجمركية المستحقة عليه أو على مؤسسته و سدادها من خلال فروع البنك والتى تقدم هذه الخدمة , حيث يتم التأثير الفورى على بيانات العميل بما يفيد السداد.