اقام الدكتور محمد البلتاجى القيادى الاخوانى والمحبوس حاليا على ذمة العديد من القضايا دعوتان قضائيتان امام محكمة القضاء الادرى بمجلس الدولة طالب فى الاولى بالغاء القرار الصادر بنقل محاكمات قيادات الاخوان من التجمع الخامس الى منطقة سجون طرة وطالب فى الثانية اصدار حكم قضائى بالزام الجمعية العمومية لمحكمة استئناف القاهرة بوضع معاير موضوعية لتوزيع العمل على دوائر المحكمة. حملت دعوى بلتاجى الاولى رقم 5508 لسنة 68 ق واقامها ضد كلا من وزيرى العدل والداخلية ورئيس الوزراء ووزير الجمهورية وقال فيها ان نقل محاكمات الاخوان من التجمع الخامس الى سجون طرة مخالف لقانون السلطة القضائية رقم 46 لسنة 72 والذى تنص المادة السادسة منة على انه يجوز ان تنعقد محكمة الاستئناف فى اى مكان اخر فى دائرة اختصاصها او خارج هذة الدائرة عند الضرورة وبقرار من وزير العدل بناء على طلب من رئيس محكمة الاستئناف وهذا لم يتم حيث لن يطلب رئيس محكمة الاستئناف نقل محاكمات الاخوان من التجمع الخامس. وقالت الدعوى ان نقل محاكمات الاخوان الى سجن طرة تتويج لسلسلة الاجراءات الباطلة التى بدات باجراءات التحقيق داخل السجون وانتقال رجال النيابة اليها واصدار قرارات الحبس داخلها. كما ان نقل المحاكمات مخالف لمبادئ الدستور لاهدارها كافة ضمانات الحقوق الاساسية التى يتمتع بها المتهم ومنها البراءة حتى تثبت ادانتة فى محاكمة عادلة. اما الدعوى الثانية التى اقامها البلتاجى فحملت رقم 5509 لسنة 68 ق واقامها ضد كلا من وزير العدل ورئيس محكمة استئناف القاهرة واكد فيها بان عدم وضع الجمعية العمومية لمحكمة الاستئناف معاير موضوعية لتوزيع العمل على دوائر المحكمة مخالف للمادة 30 من قانون السلطة القضائية التى تلزم وضع معاير موضوعية لتوزيع القضايا ومخالف ايضا للمادة 77 من دستور عام 2012 التى تنص على ان المتهم برئ حتى تثبت ادانتة فى محاكمة عادلة تكفل لة فيها ضمانات الدفاع قال البلتاجى فى نهاية دعوته انه اقام هذة الدعوى بعد ان تنحت محكمة الجنايات يوم الثلاثاء عن نظر احدى القضايا المتهم فيها واحالتها لرئيس محكمة الاستئناف لتحديد دائرة اخرى دون ان يكون هناك لمعاير لاختيار الدائرة الجديدة التى يحاكم امامها.