أكدت هيئة كبار العلماء، أنَّ مناهجَ التعليمِ في الأزهرِ الشريفِ في القَدِيمِ والحديثِ هي وحدَها الكفيلةُ بتعليمِ الفكرِ الإسلاميِّ الصحيح الذي يَنشُرُ السلامَ والاستقرارَ بينَ المسلمين أنفسهم، وبين المسلمين وغيرهم. وأضافت الهيئة فى بيان لها، أن ذلك يشهَدُ عليه الملايين التي تخرَّجت في الأزهر من مصرَ والعالم، وكانوا ولا يزالون دُعاةَ سلامٍ وأمنٍ وحُسن جوار، لافتة إلى أنه من التدليس الفاضح وتزييف وعي الناس وخيانة الموروث تشويه مناهج الأزهر واتهامها بأنها تفرخ الإرهابيين. وتابعت الهيئة "والحقيقة التي يَتنكَّرُ لها أعداء الأزهر بل أعداء الإسلام هي أن مناهج الأزهر اليوم هي نفسها مناهج الأمس التي خرجت رواد النهضة المصرية ونهضة العالم الإسلامي بداية من حسن العطار ومرورا بمحمد عبده والمراغي والشعراوي والغزالي، ووصولا إلى رجال الأزهر الشرفاء الأوفياء لدينهم وعلمهم وأزهرهم، والقائمين على رسالته في هذا الزمان". وأشارت هيئة كبار العلماء، إلى أن هؤلاء المنكرين ضوء الشمس في وضح النهار عليهم أن يلتفتوا إلى المنتشرين في جميع أنحاء العالم من أبناء الأزهر، ومنهم رؤساء دول وحُكومات ووزراء وعلماء ومفتون ومُفكرون وأدباء وقادة للرأي العام، ويتدبروا بعقولهم كيف كان هؤلاء صمام أمن وأمان لشعوبهم وأوطانهم، وكيف كان الأزهر بركةً على مصر وشعبها حيث جعَل منها قائدًا للعالم الإسلامي بأسرِه وقبلةً علميَّةً لأبناءِ المسلمين في الشرق والغرب. كانت انتقادات كثيرة طالت مؤسسة الأزهر الشريف مؤخرًا عقب تفجير كنيستي مارجرجس بطنطا والمرقسية بالإسكندرية، تمثل أبرزها في اتهام الأزهر بالفشل فى تجديد الخطاب الدينى وعدم قدرته على الوصول إلى عقول المتطرفين والإرهابيين إضافة إلى الادعاء بتدريس مناهج تحض على قتل غير المسلمين واستحلال أموالهم ونسائهم وأطفالهم. وقال الدكتور عباس شومان وكيل الأزهر، إنه تم تشكيل لجنة لتطوير مناهج الأزهر منذ صدور قرار الدكتور أحمد الطيب شيخ الأزهر لإصلاح وتطوير التعليم الأزهرى فى 2013 ضمت أكثر من 100 خبير من داخل وخارج الأزهر. وأضاف شومان، أن اللجنة ساهمت فى تطوير وتعديل جميع مقررات التعليم ما قبل الجامعي في الأزهر، بالإضافة لمراجعة مناهج جامعة الأزهر، موضحًا أن التعديل شمل تبسيط العبارات التراثية بعبارات معاصرة سهلة، وحذف الاستطرادات المطولة في الكتب، كما تم حذف بعض الأبواب التى لم تعد مرتبطة بالعصر. وقال الدكتور محمد أبو زيد الأمير، رئيس قطاع المعاهد الأزهرية، إن التطوير فى المناهج التعليمية بالمعاهد الأزهرية تم بشكل كامل، كما أنها عرضت على الجمهور العام فى معرض الكتاب الأخير، وأثنى عليها الجميع. وأضاف الأمير، أنه تم تطوير 44 كتابا في مراحل التعليم الأزهري المختلفة، بالتعليم قبل الجامعي، من خلال لجنة تطوير المناهج، ليكون الطالب الأزهري مواكبا لمتغيرات العصر، مشيرا إلى أن المناهج بعد التطوير أصبحت مواكبة للعصر تمامًا.