زعمت تقارير صحفية قبرصية، أن مختطف الطائرة المصرية بقبرص هو ضابط مصري سابق. اسمه سيف الدين مصطفى. وكانت قد تضاربت الروايات بشأن هوية خاطف الطائرة المصرية، حيث تداولت الأنباء عن كون المختطف جنسيته ليبي وطليقته اسمها ماريا من قرية قرب لارناكا. يذكر أن مصادر أمنية أفادت بأن مختطف الطائرة هو سيف الدين مصطفى وليس إبراهيم سماحة. ومن جانبها، قالت إدارة مطار برج العرب الدولي، إن خاطف الطائرة المصرية إيرباص 320 هو سيف الدين مصطفى عمر، مدرس تاريخ بمنطقة الضاهر التعليمية بالقاهرة، وليس الدكتور إبراهيم عبد التواب سماحة. وأضافت إدارة المطار، فى بيان صحفى منذ قليل، أن الدكتور "سماحة" والذى يعمل طبيبا بيطريا من ضمن الركاب الذى أفرج عنهم بمطار قبرص بحسب ما ذكرت وكالة أونا. وطالبت إدارة المطار وسائل الإعلام بالتواصل مع وزارة الطيران المدنى بالقاهرة عقب هذا التصريح بعد صدور تعليمات بمنعهم من الإدلاء بأى تصريحات. كانت الطائرة المصرية المتجهة من مطار برج العرب بالإسكندرية إلى مطار القاهرة قد تعرضت للاختطاف فى الساعة الثامنة والنصف وعلى متنها 55 راكبا بينهم 8 بريطانيين و10 أمريكيين. وعرضت طائرة تابعة لشركة مصر للطيران لعملية خطف، الثلاثاء 29 مارس 2016، كانت تقوم برحلة بين الإسكندريةوالقاهرة، وأجبرت على الهبوط فى مطار لارنكا القبرصي، حيث تم الإفراج عن القسم الأكبر من الركاب فيما أكدت السلطات عدم وجود رابط بعمل إرهابي. كما أكدت مصادر قبرصية، أن الخاطف طلب لجوءاً سياسياً، بعد أن قام بالإفراج عن غالبية ركاب الطائرة عدا الطاقم و5 أجانب. من جهته، أفاد مسؤول فى الحكومة القبرصية أن الخاطف طلب رؤية زوجته السابقة القبرصية، موضحاً أن المراة تقيم فى بلدة "اوروكليني" القريبة من المطار. ومن جانبه ،رفض وزير الطيران خلال مؤتمر صحفى الكشف عن هوية خاطف الطائرة المصرية، لدواعٍ أمنية.