قرر مجلس الشورى العام للإخوان المسلمين، فصل الدكتور عبد المنعم أبو الفتوح من عضوية الجماعة، بناءً على ما أوصت به لجنة التحقيق الدائمة في جلسة 18/6/2011، بعد إعلانه الترشح لرئاسة الجمهورية بالمخالفة لقرار مجلس الشورى العام في 10/2/2011م والمؤكد في جلسة مجلس الشورى 29، بتاريخ 30/4/2011م، وكذلك الخروج على نُظُم وقواعد الجماعة. كما قرر المجلس قبول اعتذار الدكتور محمد السيد حبيب، نائب المرشد العام السابق، عن عضويته بمجلس الشورى العام، مع استمراره أخا عاديا في الجماعة. وكان المجلس قد انعقد بجلسته العادية في الدورة الرابعة 2010-2014، اليوم السبت، برئاسة المرشد العام، بصفته رئيس المجلس، وحضور 105 أعضاء وغياب 4 أعضاء، بينهم أبو الفتوح وحبيب، واعتذار 11 عضوا بسبب السفر أو المرض.