حذّر قادة سابقون في جهاز الموساد وخبراء عسكريون ومُحلّلون إستراتيجيون إسرائيليون من صعود جماعة "الإخوان المسلمين" للحكم في مصر، ويرون أن وصولهم لسدة الحكم يعدّ أشد خطورة على إسرائيل من حصول إيران على سلاحٍ نوويٍّ. ونقلت صحيفة " جيروسلم بوست " الإسرائيلية عن رئيس " الموساد " الأسبق شبتاي شفيط وحاييم آسا، الذي عمل مستشارًا سياسيًا لرئيس الوزراء الإسرائيلي السابق إسحاق رابين، بالإضافة إلى جنرالات متقاعدين قولهم: "إنّ جماعة الإخوان المسلمين ستحاول القضاء على مشروع الدولة اليهودية في إسرائيل، وهو ما يُضاعِف خطورة طموحها للوصول للحكم في مصر على وجه الخصوص". وشدَّد العسكريون الإسرائيليون على أنّ هناك احتمالاً كبيرًا أن تصل جماعة "الإخوان المسلمون" للحكم في مصر، كونها أكبر وأقوى جماعة سياسية منظمة، ونظرًا لتمرُّس الجماعة في العمل السياسي لفترة طويلة، وهي العملية التي انتهت بتشكيل حزب سياسي لهم، يَحْظَى باعتراف الدولة، علاوةً على زيادة قوة الجماعة بعد سقوط نظام مبارك ومؤسساته الأمنية التي كانت تعمل على قمع الجماعة وتضيق الخناق على قياداتها وعناصرها. وحثّ الجنرالات المتقاعدون دوائر صنع القرار في إسرائيل على مراقبة الأوضاع الداخلية في مصر بشكل ثاقب، مشددين على أنّ إمكانية وصول الجماعة للحكم سيناريو يفوق في خطورته إمكانية تطوير إيران السلاح النووي.