اعترض ممثلو الأزهر بلجنة الخمسين على تعديل المادة الثالثة التي أقرتها لجنة المقومات الأساسية لتعديل الدستور، والتي أقرت باستبدال فقرة "المسيحيين واليهود" ب"غير المسلمين"، ليصبح نص المادة "لغير المسلمين الاحتكام لشرائعهم فيما يتعلق بأحوالهم الشخصية وقياداتهم الروحية. وكانت تلك المادة تنص فى الدستور المعطل 2012 على "مبادئ شرائع المصريين من المسيحيين واليهود المصدر الرئيسي للتشريعات المنظمة لأحوالهم الشخصية، وشئونهم الدينية، واختيار قياداتهم الروحية". وأعرب د ممثلو الأزهر باللجنة عن تحفظهم على تعديل المادة الثالثة ورفضهم بالإجماع حذف المسيحيين واليهود من المادة الثالثة واستبدالها بغير المسلمين على إطلاقها. صرح بذلك المستشار محمد عبد السلام مقرر لجنة الدولة والمقومات الأساسية.