في مفاجأة كبيرة, تبرأ "تحالف دعم الشرعية" من واقعة الاعتصام بمترو الأنفاق في 15 سبتمبر. وقال أمين عام تحالف دعم الشرعية مجدي قرقر إن رافضي الانقلاب لا يحبذون مثل هذه الأعمال التي تعطل المصالح والخدمات العامة، وإنما يعتمدون الاحتجاج بطرق سلمية لا تتعارض مع مصالح المواطنين. ولم يستبعد قرقر في تصريحات لقناة "الجزيرة" في 16 سبتمبر أن تكون هذه الدعوة مدسوسة لتشويه صورة التحالف والرافضين ل"الانقلاب". وبدوره, قال عيد النجار المناصر للرئيس المعزول محمد مرسي إن جماعة الإخوان المسلمين لم تدع أفرادها للتواجد عند محطات المترو لتعطيل حركة سيره من الساعة ال7 صباحا حتى ال11 قبل الظهر، مضيفا أنه علم بهذه الدعوة من مواقع التواصل الاجتماعي فقط. وأضاف النجار أنه لم يستجب لهذه الدعوة، لأنها أطلقت عبر مبادرات فردية، وربما روج لها البعض بهدف تشويه "الإخوان" وإظهار أنهم يعطلون مصالح الناس, لثني المواطنين عن التعاطف معهم. ومن جانبه، قال وليد كمال, الناشط على موقع فيسبوك والمناصر للشرعية, إن هذه الدعوة مجهولة المصدر ولا يُعلم من أطلقها على وجه التحديد. وأكد كمال ل "الجزيرة" أن شباب الإخوان المسلمين وتحالف دعم الشرعية لم يتلقوا توجيهات مباشرة بالاعتصام داخل المترو، قائلا إن توقيت الاعتصام يثير الشكوك لأنه ليس من المعتاد أن ينظم أنصار الشرعية أنشطة في الصباح. يشار إلى أن حركة القطارات انتظمت في 15 سبتمبر على خطوط مترو الأنفاق بشكل طبيعي في الاتجاهين ولم يحدث أي نشاط يعرقل مسارها. وخصصت الشركة المصرية لإدارة وتشغيل المترو سبعة قطارات إضافية فارغة موزعة على المحطات الرئيسة، للدفع بها فى حالة الضرورة، فيما ألقت الشرطة القبض على خمسة أشخاص بمحطة مترو "سانت تريزا" أثناء قيامهم بكتابة عبارات وشعارات منددة ب "الشرطة والجيش". وبدوره, قال عبد الله فوزى رئيس الهيئة القومية لمترو أنفاق القاهرة إن حركة قطارات الخطوط الثلاثة بالمترو لم تتأثر بدعوات أنصار الرئيس المعزول محمد مرسي للاعتصام داخل المترو, كجزء من العصيان المدني, إلا أنه أشار إلى وجود زحام في عدد من المحطات الرئيسة في أوقات الذروة صباحا، لكن الحركة سارت بانتظام بعد ذلك.