أهل مصر طالبوا زوجها بدفنها فى بلدهم فاستجاب لطلبهم.. والإمام الشافعى أوصى بأن تصلى عليه السيدة نفيسة لا تكاد تجد أسرة فى مصر منذ أوائل القرون الهجرية حتى أوائل القرن العشرين، إلا وفيها من تحمل اسم سيدة من سيدات آل البيت، وخصوصًا من أقمن وتم دفنهن فى مصر، لتعلق المصريين بآل البيت، وعشقهم الشديد للرائحة الزكية والنسب الشريف. وقد قدمت إلى مصر مع أسرتها، فى الخفاء، إلا أن خبر وصول موكبها الشريف وصل لأهالى مصر، فذهبوا لاستقبالها فى العريش بالمواكب، ومنذ وضع رحالها فى مصر واستقرارها فيها، وأهل مصر من المحبين والمريدين يتوافدون أفواجًا إلى بابها لحضور دروسها والاستفادة من علمها والخير الذى تمتلكه، وهو ما أصابها بالضيق وعدم القدرة على الاستمرار فعزمت الرحيل عن مصر قاصدة مدينة المصطفى، فقالت: كنتُ قد اعتزمت المقام عندكم، غير أنى امرأة ضعيفة، وقد تكاثر حولى الناس فشغلونى عن أورادي، وجمع زاد معادي، وقد زاد حنينى إلى روضة جدى المصطفى. وعند علم والى مصر بنية السيدة نفيسة فى الرحيل، تعهد لها بإزالة الأسباب التى تسبب لها الضيق، فوهبها بيتًا أوسع، وحدد يومين فى الأسبوع لزيارات الناس، فاقتنعت واستمر مقامها فى مصر إلى أن رحلت. وأثناء مقامها الشريف فى مصر، وفد الشافعى إلى مصر، قاصدًا التعلم من مذهب الإمام «الليث بن سعد» من تلاميذه بعد رحيله، بعدما تتلمذ على يد الإمام مالك فى المدينة، واختلف مع مذهب الإمام أبى حنيفة فى العراق، فقصد مصر، وعند استقراره فيها، تبادل الزيارات مع السيدة نفيسة، للاستزادة من علمها وفقهها، وكان كل زيارة يسألها الدعاء، حيث اشتهرت أنها مستجابة الدعوة. ولما توفى الإمام الشافعى أوصى قبل وفاته بأن تصلى عليه السيدة نفيسة، وبالفعل مرت الجنازة من أمام بيتها وصلت عليه بالفعل. ولما توفيت السيدة نفيسة أصر زوجها إسحق المؤتمن بن الإمام جعفر الصادق، على أن يذهب بجثمانها للمدينة ليدفن بالبقيع مع جدها المصطفى وآله الطيبين الطاهرين، ولما علم أهل مصر بهذا الخبر، توافدوا إلى والى مصر حتى يقنع زوجها الإمام إسحق أن يدفنها فى مصر، إلا أنه أبى، فعرضوا عليه مالًا كثيرًا فأبى أيضًا، إلا أنهم فى الصباح وجدوه مستجيبًا لهم، فلما سألوه عن السبب، قال لهم إنه رأى رسول الله وأمره بأن يدفنها فى مصر. ومن يومها وأهل مصر يتوافدون إلى مشهدها ومسجدها محتفين بها وبمقامها وسطهم، يقع مشهد السيدة نفيسة أو مسجد السيدة نفيسة فى منطقة السيدة نفيسة بالقاهرة، المسماة قديمًا بدرب السباع. ويقع فى بداية الطريق المسمى طريق أهل البيت، حيت يصبح المشهد النفيسى هو المحطة الثانية فى هذا الطريق بعد مشهد الإمام على زين العابدين (مقام رأس زيد بن علي). وطريق أهل البيت طريق مشهور يبدأ بمقام زين العابدين وينتهى بمشهد السيدة زينب بنت على مرورا بالسيدة نفيسة والسيدة سكينة بنت الحسين والسيدة رقية بنت على بن أبى طالب وسيدى محمد بن جعفر الصادق والسيدة عاتكة عمة الرسول محمد عليه الصلاة والسلام وعلى آله الكرام. ويتجمع العشاق والمريدون فى أعداد مهولة فى مولدها، وبينهم المجاذيب الذين اعتبرهم ابن خلدون نوعا من الأولياء مع سقوط التكاليف عنهم، وعند كبار المتصوفة يُعتبر المجاذيب النوع الأعلى من الأولياء، حيث اشتهروا بالوصال ورؤية الغيب وقراءة السرائر، والإخبار بما يحدث فى الخفاء، وما سيحدث، حيث أمر الإمام عبد الوهاب الشعرانى بعدم مخالطتهم حتى لا يطلعوا على ما ستره الله.
