أسفرت قرعة دوري أبطال إفريقيا لموسم 2016 عن وقوع الأهلي مع الفائز من ريكرياتيفو بولو بطل أنجولا وراسينج كلوب بطل غينيا الإستوائية. وقد جنبت القرعة اشتراك الأهلي في دور ال64 بسبب تاريخه الكبير في القارة السمراء. يذكر أن الأهلي هو بطل نسخة 2012 و2013 من دوري أبطال إفريقيا إلا أنه خرج من ال16 في نسخة 2014 و2015.