قرر المجلس الأعلى للأزهر في اجتماعه الطارئ الأربعاء 3أبريل برئاسة فضيلة الإمام الأكبر شيخ الأزهر د. أحمد الطيب الدعوة لانتخابات رئاسة جامعة الأزهر. وأضاف المجلس يتم تشكيل لجنة لوضع قواعد انتخاب رئيس جامعة الأزهر وعرضها على المجلس الأعلى خلال أسبوعين على أن تنتهي الانتخابات فور إقرار هذه القواعد. كما قرر المجلس تغيير عدد من القيادات بالمدينة الجامعية للبنين والبنات ومنها مدير عام التغذية بالمدينة الجامعية بنين وبنات وإحالة المتسببين في أحداث المدينة الجامعية للتحقيق العاجل ومتابعة تحقيق النيابة العامة في هذا الصدد. كما قرر المجلس الأعلى للأزهر الإعلان عن وظائف جديدة للجامعة في القاهرة والأقاليم لتحسين الخدمات بالمدينة الجامعية وتكليف إدارة الجامعة بالتعاقد مع شركة لتجهيز المطابخ بالمدن الجامعية للبنين وللبنات . كما كلف المجلس الأعلى للأزهر وهو أعلى سلطة إدارية للأزهر إدارة الجامعة للتعاقد مع شركة نظافة مناسبة لأعمال النظافة والتطهير ومكافحة الحشرات وتكليف عملاء الكليات بإجراء حوار مفتوح مع الطلاب . كما طالب المجلس الأعلى للأزهر تيارات والقوى السياسية والمجتمعية باحترام استقلال الأزهر بكافة شئونه وفقا للدستور والقانون . وأكد المجلس احترامه التام لحق الطلاب في التعبير عن مطالبهم بشكل سلمى ولائق معربا عن أسفه لبعض التجاوزات التي صاحبت تعبير الطلاب عن أرائهم .