تأخر قيام القطار 989 من محطة أسوان بعد اكتشاف عطل في إحدى عرباته، مساء اليوم الأربعاء، والذي كان مقررا إقلاعه من أسوان في الساعة التاسعة والنصف مساء، مما اضطر المسئولين بمحطة أسوان إلى إنزال جميع ركاب القطار. وظل الركاب في المحطة انتظارا لاستبدال العربة المعطلة بعربة من قطار 980 القادم من القاهرة إلى أسوان، وحتى وقت نشر الخبر لم يصل القطار المقرر أن يتم استبدال العربة المعطلة بإحدى عرباته.