نشبت أزمة داخل مجلس النواب بعد إعلان رئيس البرلمان د.على عبد العال أنه لن يناقش الأوضاع التي حدثت في سيناء وأنه سيكتفي بمناقشة ما ورد بجدول أعمال الجلسة الطارئة لتعديل قانون هيئة المحطات النووية لتوليد الكهرباء، الأمر الذي أثار غضب النواب الذين رفضوا ما قاله رئيس المجلس، وفيما أصر النواب على موقفهم، شدد رئيس المجلس علي أن مناقشة أي أمر بخلاف ما ورد بجدول أعمال الجلسة الطارئة يخالف اللائحة. وقال رئيس المجلس "هذا الحدث مؤلم وبشع وموجع والمجلس أصدر بيانًا يعبر عن ألم وحزن جميع الأعضاء وتضامنهم مع الأجهزة الأمنية، موضحًا أن المجلس يقوم بمهمة التشريع والرقابة. وأضاف "الحادث تسبب في وجع للمصريين والعالم ووحد المصريين جميعًا وانتهت المواقف الضبابية وأصبح الجميع على قلب رجل واحد وتحدثت بصفتي رئيس للمجلس وعبرت عن الجميع ثم سرد البيان الذي أصدره البرلمان بعد الحادث.