حالة من القلق أصابت الباحثين علي مشروعاتهم البحثية نظرا لعدم استقرار الأحوال بصندوق العلوم والتنمية التكنولوجية خاصة أنه أكبر جهة تمويلية للبحث العلمي في مصر . حيث يقوم الصندوق بتمويل مشروعات لجامعة القاهرة والمركز القومي للبحوث ومركز البحوث الزراعية وجامعة الإسكندرية وعين شمس وكافة الجامعات والمراكز البحثية الكبري. وقد أثار عدم الاستقرار خاصة عدم وضوح مستقبل الصندوق والتمويل المتاح للصندوق حفيظة عدد كبير من الباحثين خاصة التشكيك في مشروعاتهم البحثية الجادة التي بدأت تؤتي ثمارها وبتشكيك هؤلاء الباحثين في نوايا الدولة لاتاحة التمويل للمشروعات البحثية في ظل الظروف الاقتصادية الحالية مما يضع ظلالا من الشك علي توجه الدولة في تمويل البحث العلمي والتكولوجيا. وكان صندوق العلوم والتنمية التكنولوجية قد انشيء بالقرار الجمهوري رقم218 لسنة2007 وبدأ عمله عمله في25 فبراير2008 وذلك لكفالة تمويل البحث العلمي والتكنولوجيا وجاء انشاء الصندوق لتدني تمويل البحث العلمي في مصر الذي لم يكن يتعدي20 مليون جنيه سنويا للمشروعات البحثية ليصبح حاليا200 مليون جنيه سنويا, وأكد عدد من الباحثين بأن مشروعاتهم الممولة من الصندوق قد أدت الي ظهور براءات اختراع. كما ان العديد من الباحثين قد قام بنشر ابحاث علمية في مجالات عالمية نتيجة للتمويل من الصندوق. ويتساءل الباحثون عن مصير براءات الاختراع التي كان الصندوق قد وعد بتمويلها مجددا للوصول الي منتجات تخدم الاقتصاد الوطني المصري. وأشار بعضهم في حسرة الي ضياع مجهوداتهم في خلال السنوات الماضية من خلال المشروعات التي أعطت لهم الأمل في توجه الدولة في البحث العلمي, وكان الصندوق يقوم بتمويل المشروعات الوطنية في البحوث الأساسية والتطبيقية, كما كان يقوم بتمويل المشروعات القومية الموجهة التي أوصي بها المجلس الأعلي للعلوم والتكنولوجيا في مجالات الصحة( فيروس2) والطاقة المتجددة والزراعة وتحلية المياه باجمالي400 مشروع بحثي, وكانت هيئة المعونة الأمريكية قد وعدت الحكومة المصرية بتوفير20 مليون دولار وفي نفس الوقت قامت بمراجعة أعمال الصندوق خلال عام2009 بفريق عمل مصري أمريكي مشترك وذلك لمراجعة أعمال الصندوق الذي يعمل كهيئة مستقلة بدون المعوقات التي تحد من أعمال الهيئات الحكومية وبناء علي ذلك فقد أوصي التقرير بتمويل20 مليون دولار الي الحكومة المصرية نتيجة لنجاح الصندوق في تحقيق هذه الأهداف وتم التمويل للحكومة المصرية خلال عام.2010 وجدير بالذكر ان الصندوق يمول حوالي400 مشروع بحثي باجمالي تمويل مايزيد علي400 مليون جنيه, وأنه قد قام بمحاكاة النظم التي تقوم بعملها هيئة التمويل الألمانية التي أرسلت فرق عمل4 مرات خلال الثلاث سنوات السابقة ونتج عن ذلك محاكاة الصندوق لهيئة التمويل الألمانية في عملها وتوقيع اتفاقية في ديسمبر2010 بين الصندوق والهيئة الألمانية التي تضمنت تعاون الصندوق والجانب الألماني في المشروعات البحثية واستمرار دعم الجانب الأمني لتطوير أنظمة الصندوق حتي يتخطي المعوقات الحالية. وأوضح الدكتور ماجد الشربيني رئيس أكاديمية البحث العلمي ان كل ارتباطات التزم بها الصندوق طبقا للوائح والقواعد القانونية المتعارف عليها سوف يتم تنفيذها بالكامل وان خطة عمل الصندوق يتم اعتمادها من مجلس إدارة الصندوق طبقا للخطة التي وافق عليها المجلس الأعلي للعلوم والتكنولوجيا. وان مرحلة مراجعة أنشطة الصندوق في المرحلة السابقة تم الانتهاء منها وان الصندوق يعمل حاليا بكافاءة تامة.